Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Kdm5dQ62240 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Kdm5dQ62240 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Kdm5dQ62240 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms