Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sin3bQ62141 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sin3bQ62141 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sin3bQ62141 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms