Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BcanQ61361 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcanQ61361 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcanQ61361 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcanQ61361 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BcanQ61361 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcanQ61361 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BcanQ61361 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcanQ61361 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcanQ61361 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BcanQ61361 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BcanQ61361 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BcanQ61361 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BcanQ61361 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BcanQ61361 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BcanQ61361 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BcanQ61361 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BcanQ61361 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BcanQ61361 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BcanQ61361 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BcanQ61361 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BcanQ61361 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BcanQ61361 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms