Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
JrkQ60976 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
JrkQ60976 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JrkQ60976 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
JrkQ60976 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
JrkQ60976 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JrkQ60976 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
JrkQ60976 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
JrkQ60976 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
JrkQ60976 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms