Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DbpQ60925 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DbpQ60925 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DbpQ60925 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DbpQ60925 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DbpQ60925 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DbpQ60925 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DbpQ60925 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DbpQ60925 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DbpQ60925 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms