Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tdrd5Q5VCS6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tdrd5Q5VCS6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tdrd5Q5VCS6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms