Protein–RNA interactions for Protein: Q5U430

Ubr3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr3Q5U430 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubr3Q5U430 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubr3Q5U430 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubr3Q5U430 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubr3Q5U430 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubr3Q5U430 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubr3Q5U430 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubr3Q5U430 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubr3Q5U430 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubr3Q5U430 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubr3Q5U430 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubr3Q5U430 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubr3Q5U430 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubr3Q5U430 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubr3Q5U430 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubr3Q5U430 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubr3Q5U430 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubr3Q5U430 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubr3Q5U430 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubr3Q5U430 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms