Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tns3Q5SSZ5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tns3Q5SSZ5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tns3Q5SSZ5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tns3Q5SSZ5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tns3Q5SSZ5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tns3Q5SSZ5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tns3Q5SSZ5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tns3Q5SSZ5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tns3Q5SSZ5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tns3Q5SSZ5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tns3Q5SSZ5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tns3Q5SSZ5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tns3Q5SSZ5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tns3Q5SSZ5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms