Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Utp18Q5SSI6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Utp18Q5SSI6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Utp18Q5SSI6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms