Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CoblQ5NBX1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CoblQ5NBX1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms