Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp22Q5DU02 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp22Q5DU02 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp22Q5DU02 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms