Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q504N7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q504N7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q504N7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q504N7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q504N7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q504N7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q504N7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q504N7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q504N7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q504N7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q504N7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q504N7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q504N7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q504N7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q504N7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q504N7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q504N7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q504N7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q504N7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q504N7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Q504N7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q504N7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q504N7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q504N7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q504N7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q504N7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q504N7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q504N7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q504N7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q504N7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q504N7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q504N7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q504N7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q504N7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q504N7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q504N7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q504N7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q504N7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q504N7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q504N7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q504N7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q504N7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q504N7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q504N7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q504N7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q504N7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q504N7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q504N7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q504N7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q504N7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q504N7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q504N7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q504N7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q504N7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q504N7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q504N7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q504N7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q504N7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q504N7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q504N7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q504N7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q504N7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q504N7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q504N7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q504N7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q504N7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q504N7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q504N7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q504N7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q504N7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q504N7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q504N7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q504N7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q504N7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q504N7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q504N7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q504N7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q504N7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q504N7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q504N7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q504N7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q504N7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q504N7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q504N7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q504N7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q504N7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q504N7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q504N7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q504N7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q504N7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q504N7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q504N7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q504N7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q504N7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q504N7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q504N7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q504N7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q504N7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q504N7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms