Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmub2Q3V209 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms