Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930596D02RikQ3V0H9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930596D02RikQ3V0H9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms