Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cfap65Q3V0B4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cfap65Q3V0B4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cfap65Q3V0B4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cfap65Q3V0B4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms