Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capn13Q3UW68 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms