Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm648Q3UJ22 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm648Q3UJ22 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm648Q3UJ22 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm648Q3UJ22 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm648Q3UJ22 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm648Q3UJ22 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm648Q3UJ22 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm648Q3UJ22 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm648Q3UJ22 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm648Q3UJ22 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm648Q3UJ22 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm648Q3UJ22 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm648Q3UJ22 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm648Q3UJ22 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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