Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf224Q3UIW8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Rnf224Q3UIW8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms