Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Tnrc6cQ3UHC0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnrc6cQ3UHC0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms