Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft2Q3UF64 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnft2Q3UF64 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms