Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEZ8

Slc10a4, Sodium/bile acid cotransporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a4Q3UEZ8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc10a4Q3UEZ8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc10a4Q3UEZ8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc10a4Q3UEZ8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms