Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trafd1Q3UDK1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trafd1Q3UDK1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms