Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cops9Q3U898 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cops9Q3U898 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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