Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3U595 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3U595 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U595 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U595 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U595 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U595 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U595 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U595 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U595 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U595 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U595 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q3U595 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U595 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U595 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U595 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U595 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U595 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U595 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U595 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U595 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U595 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U595 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U595 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U595 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U595 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U595 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U595 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U595 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q3U595 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U595 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U595 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U595 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U595 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U595 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U595 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U595 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U595 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U595 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U595 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3U595 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U595 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U595 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U595 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U595 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U595 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U595 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3U595 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U595 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U595 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U595 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U595 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U595 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U595 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U595 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U595 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U595 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U595 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U595 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U595 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U595 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3U595 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U595 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U595 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U595 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U595 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U595 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U595 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U595 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U595 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U595 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U595 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U595 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U595 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U595 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U595 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U595 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3U595 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3U595 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3U595 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3U595 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U595 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U595 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U595 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U595 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U595 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U595 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U595 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U595 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U595 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U595 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U595 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U595 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U595 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q3U595 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U595 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U595 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U595 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U595 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q3U595 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms