Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rasip1Q3U0S6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rasip1Q3U0S6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms