Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccdc136Q3TVA9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ccdc136Q3TVA9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ccdc136Q3TVA9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ccdc136Q3TVA9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms