Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Smarca4Q3TKT4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Smarca4Q3TKT4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Smarca4Q3TKT4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Smarca4Q3TKT4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms