Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hddc2Q3SXD3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hddc2Q3SXD3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms