Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpusd3Q14AI6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpusd3Q14AI6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpusd3Q14AI6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms