Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
StumQ0VBF8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
StumQ0VBF8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
StumQ0VBF8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
StumQ0VBF8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
StumQ0VBF8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
StumQ0VBF8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
StumQ0VBF8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
StumQ0VBF8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
StumQ0VBF8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
StumQ0VBF8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
StumQ0VBF8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms