Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vmn1r181Q0P547 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r181Q0P547 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms