Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrstQ06666 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrstQ06666 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SrstQ06666 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrstQ06666 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrstQ06666 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrstQ06666 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrstQ06666 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms