Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cab39Q06138 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cab39Q06138 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms