Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fmn1Q05860 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Fmn1Q05860 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Fmn1Q05860 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms