Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Muc1Q02496 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Muc1Q02496 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms