Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cacna1cQ01815 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cacna1cQ01815 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cacna1cQ01815 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms