Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp1Q01514 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gbp1Q01514 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp1Q01514 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp1Q01514 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp1Q01514 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms