Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gja5Q01231 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gja5Q01231 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gja5Q01231 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gja5Q01231 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja5Q01231 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja5Q01231 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja5Q01231 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja5Q01231 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gja5Q01231 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja5Q01231 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja5Q01231 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja5Q01231 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja5Q01231 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja5Q01231 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja5Q01231 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja5Q01231 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gja5Q01231 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gja5Q01231 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gja5Q01231 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms