Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pde1bQ01065 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pde1bQ01065 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms