Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbp1Q00915 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rbp1Q00915 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms