Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VldlrP98156 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VldlrP98156 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VldlrP98156 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VldlrP98156 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VldlrP98156 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VldlrP98156 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VldlrP98156 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VldlrP98156 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VldlrP98156 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VldlrP98156 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VldlrP98156 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms