Protein–RNA interactions for Protein: P97864

Casp7, Caspase-7, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp7P97864 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp7P97864 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp7P97864 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp7P97864 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp7P97864 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Casp7P97864 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Casp7P97864 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Casp7P97864 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Casp7P97864 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp7P97864 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp7P97864 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp7P97864 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp7P97864 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp7P97864 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Casp7P97864 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp7P97864 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Casp7P97864 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Casp7P97864 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Casp7P97864 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp7P97864 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Casp7P97864 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp7P97864 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp7P97864 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Casp7P97864 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Casp7P97864 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Casp7P97864 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp7P97864 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Casp7P97864 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casp7P97864 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casp7P97864 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casp7P97864 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casp7P97864 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casp7P97864 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casp7P97864 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Casp7P97864 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Casp7P97864 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Casp7P97864 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Casp7P97864 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Casp7P97864 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casp7P97864 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Casp7P97864 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Casp7P97864 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Casp7P97864 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Casp7P97864 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp7P97864 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp7P97864 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Casp7P97864 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp7P97864 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Casp7P97864 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp7P97864 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Casp7P97864 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp7P97864 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Casp7P97864 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Casp7P97864 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Casp7P97864 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Casp7P97864 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Casp7P97864 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Casp7P97864 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Casp7P97864 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp7P97864 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp7P97864 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp7P97864 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp7P97864 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp7P97864 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Casp7P97864 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms