Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LystP97412 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LystP97412 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LystP97412 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LystP97412 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LystP97412 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LystP97412 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LystP97412 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LystP97412 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LystP97412 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LystP97412 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LystP97412 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LystP97412 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LystP97412 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LystP97412 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LystP97412 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LystP97412 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LystP97412 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LystP97412 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LystP97412 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LystP97412 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LystP97412 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LystP97412 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LystP97412 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LystP97412 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LystP97412 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LystP97412 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LystP97412 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LystP97412 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LystP97412 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LystP97412 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LystP97412 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LystP97412 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LystP97412 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LystP97412 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LystP97412 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LystP97412 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LystP97412 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LystP97412 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LystP97412 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LystP97412 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LystP97412 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LystP97412 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LystP97412 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LystP97412 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LystP97412 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LystP97412 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LystP97412 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LystP97412 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LystP97412 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LystP97412 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LystP97412 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LystP97412 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LystP97412 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LystP97412 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LystP97412 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LystP97412 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LystP97412 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LystP97412 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LystP97412 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LystP97412 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LystP97412 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LystP97412 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LystP97412 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LystP97412 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LystP97412 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LystP97412 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LystP97412 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LystP97412 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LystP97412 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LystP97412 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LystP97412 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LystP97412 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LystP97412 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LystP97412 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LystP97412 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LystP97412 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LystP97412 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LystP97412 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LystP97412 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LystP97412 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LystP97412 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LystP97412 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LystP97412 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LystP97412 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LystP97412 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LystP97412 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms