Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg1P97376 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg1P97376 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Frg1P97376 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frg1P97376 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg1P97376 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg1P97376 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg1P97376 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frg1P97376 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frg1P97376 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frg1P97376 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms