Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeboxP70368 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeboxP70368 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SeboxP70368 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SeboxP70368 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SeboxP70368 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SeboxP70368 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SeboxP70368 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms