Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lsm5P62322 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lsm5P62322 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms