Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps11P62281 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps11P62281 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps11P62281 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps11P62281 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rps11P62281 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps11P62281 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rps11P62281 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps11P62281 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rps11P62281 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms