Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrch1P62046 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrch1P62046 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms