Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rnd3P61588 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnd3P61588 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnd3P61588 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms