Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ActbP60710 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ActbP60710 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ActbP60710 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ActbP60710 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ActbP60710 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ActbP60710 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ActbP60710 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ActbP60710 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ActbP60710 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ActbP60710 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ActbP60710 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ActbP60710 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ActbP60710 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ActbP60710 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ActbP60710 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ActbP60710 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ActbP60710 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ActbP60710 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ActbP60710 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ActbP60710 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ActbP60710 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ActbP60710 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ActbP60710 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ActbP60710 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ActbP60710 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ActbP60710 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ActbP60710 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ActbP60710 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ActbP60710 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ActbP60710 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ActbP60710 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ActbP60710 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ActbP60710 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ActbP60710 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ActbP60710 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ActbP60710 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ActbP60710 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ActbP60710 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ActbP60710 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ActbP60710 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ActbP60710 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ActbP60710 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ActbP60710 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ActbP60710 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ActbP60710 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ActbP60710 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ActbP60710 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ActbP60710 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ActbP60710 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ActbP60710 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ActbP60710 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ActbP60710 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ActbP60710 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ActbP60710 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ActbP60710 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ActbP60710 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ActbP60710 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ActbP60710 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ActbP60710 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ActbP60710 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ActbP60710 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ActbP60710 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ActbP60710 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ActbP60710 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ActbP60710 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ActbP60710 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ActbP60710 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ActbP60710 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ActbP60710 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ActbP60710 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ActbP60710 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ActbP60710 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ActbP60710 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ActbP60710 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ActbP60710 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ActbP60710 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ActbP60710 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ActbP60710 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ActbP60710 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ActbP60710 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms